Учёные создадут библиотеку геномов микроорганизмов
Как сообщает «Наука в Сибири», речь идёт не только о секвенировании генома. Это лишь первый шаг, а следующий этап заключается в построении на основе геномной информации метаболической карты организма, где видно, какие биохимические реакции могут в нём протекать, а также карты генетической регуляции, с помощью которой можно показать, как взаимодействуют между собой гены. На основе этих карт будут построены математические модели, которые описывают, как происходит синтез определённого целевого продукта микроорганизмом.
В итоге учёные получат не только достоверные данные о потенциале конкретной бактерии для производства тех или иных необходимых промышленности продуктов, но и понимание, как с помощью современных генетических технологий можно менять параметры этого процесса (например, повысить интенсивность синтеза вещества или изменить какие-то его характеристики). Одновременно с фундаментальными научными задачами решаются и прикладные: идёт отбор микроорганизмов, потенциально пригодных для синтеза некоторых органических кислот, востребованных в производстве кормов для нужд сельского хозяйства.
Проанализировав геномы двухсот с лишним микроорганизмов из коллекций, новосибирские биоинформатики отобрали 17 перспективных бактерий, которые теперь будут изучены более детально. Работа с остальными геномами была не напрасной, поскольку выявленные характеристики описаны и могут быть использованы для решения других задач. Список возможного применения микроорганизмов в биотехнологической промышленности постоянно расширяется: одни бактерии используют в синтезе сырья для фармакологических производств, другие – для ликвидации загрязнения окружающей среды нефтепродуктами, третьи — в процессах переработки мусора, позволяющих превращать отходы в полезный продукт.
Новосибирские ученые рассчитывают, что уже к концу года смогут создать готовую программную платформу, которая максимально сократит срок работы с отдельным геномом микроорганизма. Первые результаты работы над ней планируется обсудить на заседаниях специального симпозиума в рамках XII международной мультиконференции «Биоинформатика и системная биология», которая пройдёт в Новосибирске. Организаторы симпозиума рассчитывают не только на обмен опытом с российскими и зарубежными коллегами, но и на возможное сотрудничество в развитии этой платформы.