У коронавируса нашли новые разновидности
Исследователи из Гарвардского университета в США и Университета Данкук в Южной Корее обнаружили несколько генетических разновидностей коронавируса SARS-CoV-2, отличающихся друг от друга нуклеотидными последовательностями в РНК-геномах. Пока неизвестно, связано ли это разнообразие вирусов с исходом заболевания COVID-19 и может ли повлиять на разработку вакцины.
Исследователи проанализировали одноцепочечные РНК-последовательности вирусов, выделенные у 11 132 пациентов с SARS-CoV-2 и хранящиеся в базе данных GISAID, которая содержит информацию о полных или частично секвенированных геномах коронавируса. Они попарно сравнили 2540 нуклеотидных последовательностей, определяя нуклеотидные замены — точечные мутации, при которых один нуклеотид РНК-последовательности заменяется на другой.
Таким образом был измерен уровень сходства между геномами SARS-CoV-2 у пациентов со всего мира. При этом было выявлено четыре обособленные ветви среди европейских и североамериканских образцов вируса. Две из них являются преимущественно европейскими, одна характерна для США, а последняя представляет собой смесь случаев заражения в США и Европе.
При этом только одна, преимущественно европейская, ветвь непосредственно связана с вирусами из Китая. Последние образуют кластер «оригинальных» вирусов, которые попали в Европу и США из Азии. Ещё одна ветвь содержит геномы из Европы, Японии, Австралии и Новой Зеландии. Получается, что геномы коронавируса варьируются в зависимости от региона, а между вирусами из Азии и западных стран существуют различия.
Изначально генетический состав SARS-CoV-2 был более однородным, однако затем стал разделяться на отдельные ветви. Распространение вируса по миру привело к большему разнообразию геномов. Результаты анализа соответствуют картине развития пандемии. По мнению учёных, усилия по разработке вакцины должны учитывать генетическую изменчивость возбудителя COVID-19.